Moleküler Docking Eğitim

moleküler docking öğren

moleküler docking öğren, moleküler docking nasıl yapılır

Moleküler docking eğitim materyalleri ile sıfırdan başta protein-ligand docking olmak üzere moleküler docking yönteminin temel prensiplerini birlikte öğreniyoruz. Bu siteden ücretsiz olarak ulaşabileceğiniz eğitim materyalleri ile sıfırdan moleküler docking öğrenebilirsiniz.

Moleküler docking materyallerini, moleküler docking öğrenmeye sıfırdan başlayan birinden ileri seviyeye kadar geniş bir yelpazede hazırlıyorum. Pek çok bakımdan eksiksiz olmasına özen gösterdiğim eğitimlerde ücretsiz yazılımların kullanımını ayrıntısıyla açıklıyorum. Eğitim materyallerin de sonuçların nasıl yorumlanacağını, hangi konulara dikkat edilmesi gerektiği, sonuçları etkileyen faktörleri ve sonuçlarımızın yanlış çıkmasına neden olabilecek faktörler üzerinde ayrıntısıyla duruyorum.

Moleküler docking, protein-ligand etkileşim enerjilerinin hesaplanmasına dayanan bir moleküler modelleme yöntemidir. Bu yöntem büyük ilaç şirketlerinden akademisyenlere kadar geniş bir yelpazede kullanılmakta ve protein-ligand etkileşimlerinin öngörülmesinde dünya genelinde kabul görmüş bir yöntemdir. Bu konuda hızla artan eğitim ihtiyacı moleküler docking için bir eksiklik oluşturmaktadır. Türkçe kaynakların yetersizliği ise dünya genelinden daha fazladır. Bu ihtiyacı karşılamak için yeni açtığım bu kategoride moleküler docking öğrenmek için ihtiyacınız olan her şeyi sağlamaya çalışacağım. Devamlı güncel tutacağım eğitim bölümü umarım moleküler dockingi kısa sürede öğrenmenizi sağlayacak ve/veya eksiklerinizin giderilmesine katkı sağlayacak.

Sonuçların yorumlanması moleküler docking için ez zor konulardan biridir. Bu konu üzerine özellikle duracağım ve yine bu bölümde protein-ligand etkileşim skorlarını kullanmadan sonuçların nasıl analiz edileceğini anlatacağım. Docking skorları son derece yüzeysel ve basit fanksiyonlara bağlıdır. Kalem kağıt bile kullanarak docking skorunu hesaplayabilirsiniz. Asıl önemli olan nokta protein-ligand kompleksinde ligandın protein içerisindeki konumu ve yaptığı kovalent olmayan etkileşimlerdir.

Ayrıca bire bir eğitimler için superpeer profilimden eğitim satın alabilirsiniz. Moleküler docking öğrenmesi zor ancak uygulaması kolay bir yöntemdir. Moleküler docking eğitim videoları için youtube kanalından da faydalabilirsiniz.

Eğitim, Moleküler Docking Eğitim

AutoDock Docking için Protein Hazırlama

Daha önceki yazımızda AutoDock Vina ile birlikte gelen AutoDock Tools aracını kullanarak ligandlarımızı nasıl hazırlayacağımızı görmüştük. Eğer bu yazıyı henüz okumadıysanız AutoDock Vina ile Docking adlı yazıyı incelemeniz faydalı olacaktır. Moleküler docking ile ligandınızın belirli bir proteine(belirli...

Devamını Oku

Moleküler Docking, Moleküler Docking Eğitim

AutoDock Vina ile Docking

AutoDock ücretsiz ve kolay kullanımı ile oldukça popüler bir moleküler docking yazılımıdır. Pek çok bakımdan önemli özellikleri içerisinde barındıran AutoDock Vina, ilaç keşif çalışmalarında özellikle ilgi çekmektedir. Litaratürde oldukça sıklıkla karşılaşılan ve kendini kanıtlamış bu yazılım kolay...

Devamını Oku

Moleküler Docking Eğitim

Moleküler Docking Nasıl Yapılır?

Moleküler docking nasıl yapılır öğrenmek için öncelikle temel bilgileri edinmek faydalı olacaktır. Bu temel bilgilerin başında kimyasal bağlar konusu gelmektedir. Temel bilgileri edindikten sonra moleküler docking nasıl yapılır sorunu sormaya başlayabilirsiniz. Bu konuda kullanabileceğiniz ücretli ve ücretsiz pek...

Devamını Oku

Eğitim, Moleküler Docking Eğitim

Moleküler Docking Öğren – İleri Seviye

İleri seviye moleküler docking öğren ve analizlerini daha daha iyi yap. Bunun için başta kimyasal bağlar olmak üzere bir dizi temel kimya bilgisini bildiğinizi kabul ediyorum. Moleküler docking eğitim sayfamızda docking konusunda ilk adımı atmak isteyenler için yararlı bilgiler bulunmakta. Burada ise moleküler docking...

Devamını Oku

Eğitim, Moleküler Docking Eğitim

Moleküler Docking Eğitim

Moleküler docking eğitim konusunda öğrendiklerimi aktardığım hem ücretli hem de ücretsiz faydalanabileceğiniz bir platformu sizlere tanıtmak istiyorum. Moleküler docking konusu üzerinde uzun süredir çalışmalar yürütüyorum. Pek çok çalışmada yer aldım ve karşılaşılan zorlukları biliyorum. Bu zorlukların...

Devamını Oku
Close