Enzimlerdeki temel prensip kimyasal tepkimeleri se\u00e7ici olarak katelizleyebilmeleridir. Enzimler pek \u00e7ok tepkimeden olu\u015fan olaylar\u0131, besin maddelerinin par\u00e7alanmas\u0131, canl\u0131 organizman\u0131n ihtiya\u00e7 duydu\u011fu molek\u00fcllerin biyokimyasal olarak sentezlenmesinde, canl\u0131da ihtiya\u00e7 duyulan herlerde hidroliz olay\u0131n\u0131n h\u0131zl\u0131 bir \u015fekilde yap\u0131lmas\u0131nda, hormonlar\u0131n sentezlenmesinde, vitaminler gibi molek\u00fcllerin sentezinde ve daha binlerce yerde \u00f6nemli ve son derece etkin g\u00f6revler al\u0131rlar. Bu da enzimlerin \u00f6zellikleri nelerdir<\/strong> ve enzim nedir<\/strong> sorusuna ba\u015fka bir cevapt\u0131r.<\/p>\n\n\n\n Enzimler bu etkili i\u015fleyi\u015flerini protein yap\u0131s\u0131nda bulunan \u00f6zel bir b\u00f6lge olan akfit merkez(veya akfif b\u00f6lge) ile yapar. Enzimlerde i\u015fleyi\u015f aktif merkez \u00fczerinden y\u00fcr\u00fcr ve substrat aktif merkeze non-kovalent etkile\u015fimlerle ba\u011flan\u0131r. Bu non-kovalent etkile\u015fim sonucunda ilgili tepkime katalizlenir ve tepkime \u00fcr\u00fcn\u00fc ortaya \u00e7\u0131km\u0131\u015f olur.<\/p>\n\n\n\n Bir grup katalitik RNA molek\u00fcl\u00fc hari\u00e7 enzomlerin b\u00fcy\u00fck bir \u00e7o\u011funlu\u011fu protein yap\u0131s\u0131ndad\u0131r. Enzimlerin aktiviteleri protein konformasyonunun b\u00fct\u00fcnl\u00fc\u011f\u00fcne ba\u011fl\u0131d\u0131r. E\u011fer bir enzim denat\u00fcre olursa, yani yap\u0131s\u0131 fiziksel etkenler taraf\u0131ndan bozulursa veya bir \u015fekilde alt birimlere ayr\u0131l\u0131rsa katalitik aktivitesi genellikle kaybolur. Enzimin alt birimlere giderek daha da ayr\u0131\u015fmas\u0131 enzimlerin etkinliklerinin kaybolmas\u0131 yani enzimin i\u015flevini yerine getirmemesi demektir. Enzimler di\u011fer proteinler gibi yakla\u015f\u0131k 12000\u2019den ba\u015flay\u0131p 1 milyonun \u00fczerine \u00e7\u0131kan molek\u00fcl k\u00fctlelerine sahiptir.<\/p>\n\n\n\n Enzilerin katalitik aktivitesini a\u00e7\u0131klayan serbest enerji- tepkime koordinat\u0131 grafi\u011fi yukar\u0131dad\u0131r. Bu grafi\u011fe bakt\u0131\u011f\u0131m\u0131zda ES ve EP olu\u015fum s\u00fcre\u00e7lerinde ge\u00e7i\u015f halinin enerjisin katalizsiz hale g\u00f6re \u00e7ok daha d\u00fc\u015f\u00fck olmas\u0131 enzimlerin katalitik aktivitelerini a\u00e7\u0131klamaktad\u0131r. Enzimler di\u011fer katalizor etkisi olan yap\u0131lar gibi kendileri ile ilgili tepkimelerin Delta G\u2019lerini d\u00fc\u015f\u00fcrmektedir. Bu da tepkimenin daha h\u0131zl\u0131 ger\u00e7ekle\u015fmesi demektir. Enzimler sentetik kataliz\u00f6rlere g\u00f6re \u00e7ok daha etkindirler. Yani akfitle\u015fme enerjisini sentetik kataliz\u00f6rlere g\u00f6re \u00e7ok daha fazla d\u00fc\u015f\u00fcr\u00fcrler.<\/p>\n\n\n\n Enzimlerin substrat ile olan ili\u015fkileri anahtar kilit modeli veya ind\u00fcklenmi\u015f uyum modeli ile a\u00e7\u0131klanmaktad\u0131r. Anahtar kilit modelinde substrat aktif merkere tam uyum ile ba\u011flan\u0131rken ind\u00fcklenmi\u015f uyum modelinde subtrat\u0131n ba\u011flanmas\u0131 ve\/veya yakla\u015fmas\u0131 ile protein yap\u0131da bir tak\u0131m de\u011fi\u015fiklikler meydana gelir ve protein substrata tam uyumlu hale gelir. Yani anahtar kilit modelinde tam uyum zaten mevcut iken ind\u00fcklenmi\u015f uyum modelinde uyumlu hale gelme s\u00f6z konusudur.<\/p>\n\n\n\n Enzimlerin baz\u0131lar\u0131 etki edebilmek ve i\u015flevlerini yerine getirmek i\u00e7in ilave kimyasal bile\u015fenlere ihtiya\u00e7 duyarlar. Bu ihtiya\u00e7 duyulan bile\u015fikler bir veya daha fazla inorganik iyon, organik bir molek\u00fcl veya koenzim olarak bilinen organometalik bir molek\u00fcld\u00fcr.<\/p>\n\n\n\n Koenzimler se\u00e7ici i\u015flevsel gruplar\u0131n ge\u00e7ici ta\u015f\u0131y\u0131c\u0131s\u0131 olarak enzimin katalizledi\u011fi reaksiyonda yer al\u0131rlar. Koenzimler \u00e7o\u011funlukla vitaminler veya vitamin t\u00fcrevleridir.<\/p>\n\n\n\n Baz\u0131 enzimler koenzim ve metal iyon(lar\u0131) ikilisi oldu\u011funda aktiflik g\u00f6sterirler. Bir koenzim veya metal iyonu bu \u00e7er\u00e7evede bak\u0131ld\u0131\u011f\u0131nda enzime \u00e7ok s\u0131k\u0131 ba\u011flanabilir. Bu t\u00fcr gruplar prostetik grup olarak isimlendirilir.<\/p>\n\n\n\n Enzimler yapt\u0131klar\u0131 i\u015flere g\u00f6re alt\u0131 \u00e7e\u015fit gruba ayr\u0131lm\u0131\u015ft\u0131r. Bu gruplar ve ayr\u0131m \u00f6zelli\u011fi a\u015fa\u011f\u0131daki gibidir.<\/p>\n\n\n\n Elektron aktar\u0131m\u0131n\u0131 sa\u011flayan enzimler bu s\u0131n\u0131fta yeral\u0131rlar. Burada y\u00fckseltgenme ve indirgenme reaksiyonlar\u0131n\u0131n katalizlenmesi s\u00f6zkonusudur. Bu s\u0131n\u0131ftaki enzimler \u00f6zellikle metabolizmadaki oksitlenmi\u015f yap\u0131lar\u0131n \u00e7evriminde \u00f6nemli g\u00f6revler al\u0131rlar. Bu konu ile ayr\u0131nt\u0131l\u0131 bilgi almak i\u00e7in glutatyon red\u00fcktaz<\/a> hakk\u0131ndaki yaz\u0131m\u0131z\u0131 inceleyebilirsiniz.<\/p>\n\n\n\n Bu s\u0131n\u0131fta bulunanlar grup aktar\u0131m\u0131 yapmaktad\u0131r. Enzimlerin ta\u015f\u0131d\u0131klar\u0131 gruplar i\u00e7erisinde H+ <\/sup>bulunmamaktad\u0131r.<\/p>\n\n\n\n Hidroliz tepkimelerini katalizler. Buna i\u015flevsel gruplar\u0131n suya aktar\u0131m\u0131 dahildir. Ba\u011flar\u0131, ba\u011flara su ekleyerek kopar\u0131r.<\/p>\n\n\n\n Bu t\u00fcrde olanlar gruplar\u0131n \u00e7ift ba\u011flara kat\u0131lmas\u0131n\u0131 veya gruplar\u0131n uzakla\u015fmas\u0131yla \u00e7ift ba\u011f olu\u015fumunu katalizlerler.<\/p>\n\n\n\n Molek\u00fcl i\u00e7i gruplar\u0131n aktar\u0131m\u0131 ile izomerik yap\u0131lar\u0131n olu\u015fumun katalizlenmesinden sorumlu olanlar bu s\u0131n\u0131fta yer al\u0131r.<\/p>\n\n\n\n Kondensasyon tepkimelerinin yard\u0131m\u0131 ile \u00e7e\u015fitli ba\u011flar\u0131n olu\u015fumunu katalileyen olanlar bu s\u0131n\u0131fta yer al\u0131rlar.<\/p>\n\n\n\n Enzimler<\/strong> hastal\u0131klar\u0131n yay\u0131lmas\u0131 ve tedavisinde \u00f6nemli olan son derece komplike yap\u0131lard\u0131r. \u00d6rne\u011fin Raltegravir \u2013 \u0130ntegraz \u0130nhibit\u00f6rlerinin \u0130lki<\/a> yaz\u0131s\u0131nda HIV v\u00fcr\u00fcs\u00fcn\u00fcn integraz enziminin<\/strong> nas\u0131l \u00e7al\u0131\u015ft\u0131\u011f\u0131 ve bu enzimin nas\u0131l inhibe edilerek hastal\u0131\u011f\u0131n tedavi edilmeye \u00e7al\u0131\u015ft\u0131\u011f\u0131 anlat\u0131lmaktad\u0131r. Bunun yan\u0131nda Molek\u00fcler Docking ve \u0130la\u00e7 Tasar\u0131m\u0131nda Kullan\u0131m\u0131<\/a> ile enzimlerin nas\u0131l inhibe edildi\u011fi modellenebilmektedir. Bu modelleme i\u015flemi molek\u00fcler dinamik \u00e7al\u0131\u015fmalar\u0131yla desteklenmekte, sonras\u0131nda ise enzim inhibisyonu ile ilgili olarak in vitro ve in vivo \u00e7al\u0131\u015fmalar yap\u0131larak bir ila\u00e7 ke\u015ffi ger\u00e7ekle\u015fmektedir.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Enzimler, Enzim Nedir, \u00d6zellikleri Nelerdir? Enzimler tepkime dengesine etki etmeyen, […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":6397,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[91],"tags":[92,93,95],"class_list":["post-6392","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-enzimler-biyokimya","tag-enzimler","tag-enzimlerin-ozellikleri","tag-enzimlerin-turleri"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/6392","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=6392"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/6392\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/media\/6397"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=6392"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=6392"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=6392"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}![\"enzimler](\"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/wp-content\/uploads\/image-15.png\")
(PDB kodu: 5FL6)<\/a>
DOI: <\/strong>10.2210\/pdb5FL6\/pdb<\/a><\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n![\"enzimler](\"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/wp-content\/uploads\/image-16.png\")
Kofakt\u00f6r ve Koenzim<\/strong><\/strong><\/h3>\n\n\n\n
Enzimler ve S\u0131n\u0131flar\u0131<\/strong><\/h2>\n\n\n\n
1. Oksidored\u00fcktazlar<\/strong> Enzimler<\/h3>\n\n\n\n
2. Transferazlar<\/strong> Enzimler<\/h3>\n\n\n\n
3. <\/strong>Hidrolazlar<\/strong><\/strong><\/h3>\n\n\n\n
4. <\/strong>Liyazlar<\/strong><\/strong><\/h3>\n\n\n\n
5. <\/strong>\u0130zomerazlar<\/strong><\/strong><\/h3>\n\n\n\n
6. <\/strong>Ligazlar<\/strong><\/strong><\/h3>\n\n\n\n