{"id":106,"count":38,"description":"Belki de geleneksel ila\u00e7 ke\u015ffi ve geli\u015ftirmesindeki en b\u00fcy\u00fck verimsizlik kayna\u011f\u0131, nihai ba\u015far\u0131 olas\u0131l\u0131\u011f\u0131 d\u00fc\u015f\u00fck olan de\u011ferlendirilen bile\u015fiklerin y\u00fcksek y\u00fczdesinden kaynaklanmaktad\u0131r. Kur\u015fun optimizasyonunda ve erken klinik \u00f6ncesi geli\u015ftirme s\u00fcre\u00e7lerinde y\u00fcksek y\u0131pranma oran\u0131n\u0131 ele almak i\u00e7in, \"odaklanm\u0131\u015f\" veya \"zenginle\u015ftirilmi\u015f\" bile\u015fik kitapl\u0131klar, sanal bir ortamda rutin olarak olu\u015fturulur. Se\u00e7ilen bile\u015fikler daha sonra sentezlenir \/ sat\u0131n al\u0131n\u0131r ve deneysel olarak taran\u0131r. Odaklanm\u0131\u015f kitapl\u0131ktaki her bile\u015fik, spesifik hedef i\u00e7in aktiviteye sahip olma olas\u0131l\u0131\u011f\u0131n\u0131 ve ayr\u0131ca klinik \u00f6ncesi geli\u015ftirme yoluyla nihai hayatta kalma olas\u0131l\u0131\u011f\u0131n\u0131 art\u0131racak yap\u0131sal ve fiziksel \u00f6zellikler dikkate al\u0131nd\u0131ktan sonra se\u00e7ilir. Niceliksel yap\u0131 \u2212 aktivite ili\u015fkisi (QSAR) model (ler) i ve \/ veya yerle\u015ftirme deneyleri, bu odaklanm\u0131\u015f bile\u015fik kitapl\u0131klar\u0131n se\u00e7imi i\u00e7in en s\u0131k kullan\u0131l\u0131r.\r\n\r\nDe novo ligand tasar\u0131m y\u00f6ntemleri, bir resept\u00f6r\u00fc veya ba\u011flanma alan\u0131n\u0131 yap\u0131sal ve \/ veya enerjik olarak tamamlayan molek\u00fclleri tasarlamak i\u00e7in hesaplama y\u00f6ntemidir. Ba\u015far\u0131l\u0131 de novo tasar\u0131m, arzu edilen ba\u011flanma b\u00f6lgeleri i\u00e7in y\u00fcksek ba\u011flanma afinitesine sahip \u00f6nerilen ligand yap\u0131lar\u0131yla sonu\u00e7lan\u0131r. De novo tasar\u0131m\u0131, ligandlar\u0131n ve substratlar\u0131n biyolojik ve deneysel bilgilerinin mevcut oldu\u011fu yerlerde en ba\u015far\u0131l\u0131 olmu\u015ftur. De novo ligand tasar\u0131m yaz\u0131l\u0131m\u0131n\u0131n geli\u015ftirilmesine iki ana yakla\u015f\u0131m uygulanm\u0131\u015ft\u0131r: molek\u00fcler par\u00e7a yakla\u015f\u0131mlar\u0131 ve s\u0131ral\u0131 b\u00fcy\u00fcme yakla\u015f\u0131mlar\u0131.\r\n\r\nMevcut de novo ligand tasar\u0131m metodolojileri, ila\u00e7 ke\u015fif programlar\u0131nda kullan\u0131mlar\u0131n\u0131 ve kabullerini ciddi \u015fekilde s\u0131n\u0131rlayan \u00fc\u00e7 ana eksiklikten muzdariptir. \u0130lk ve en \u00f6nemli eksiklik, \u00fcretilen yap\u0131lar\u0131n b\u00fcy\u00fck bir k\u0131sm\u0131n\u0131n sentetik olarak ger\u00e7ekle\u015ftirilemez olmas\u0131d\u0131r. Bu, \u00e7o\u011fu durumda ba\u011fl\u0131 fonksiyonel gruplar\u0131 k\u00f6pr\u00fclemenin ve t\u00fcm fragmanlar\u0131 en uygun konumlar\u0131nda birle\u015ftirmenin kimyasal olarak m\u00fcmk\u00fcn olmad\u0131\u011f\u0131 fragman y\u00f6ntemleri i\u00e7in \u00f6zellikle belirgindir.\r\n\r\nYakla\u015f\u0131m, yeni antimalaryal ila\u00e7 ke\u015ffi i\u00e7in dihidrofolat red\u00fcktaz (DHFR) \u00fczerinde test edildi; ancak geli\u015ftirilen y\u00f6ntemler, erken a\u015famada ila\u00e7 ke\u015ffi ve geli\u015ftirilmesinde geni\u015f \u00e7apta uygulanabilmektedir. Bu ama\u00e7la, bir ilk par\u00e7a kitapl\u0131\u011f\u0131 tan\u0131mland\u0131 ve otomatik bir par\u00e7a birle\u015ftirme algoritmas\u0131 olu\u015fturuldu. Bunlar, DHFR inhibisyonuna g\u00f6re bile\u015fiklerin \u00f6nceden taranmas\u0131 i\u00e7in bir hesaplamal\u0131 zeka tarama arac\u0131 ile birle\u015ftirildi. T\u00fcm y\u00f6ntem, bilinen DHFR inhibit\u00f6rlerinin bo\u015fluklar\u0131na g\u00f6re ve kimyasal fizibilite g\u00f6z \u00f6n\u00fcnde bulundurularak test edildi, bu da gelecekteki \u00e7al\u0131\u015fmalarda NMR do\u011frulamas\u0131na yol a\u00e7t\u0131.","link":"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/?tag=ilac-kesfi","name":"ila\u00e7 ke\u015ffi","slug":"ilac-kesfi","taxonomy":"post_tag","meta":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/tags\/106","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/tags"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/taxonomies\/post_tag"}],"wp:post_type":[{"href":"https:\/\/www.ortaakarsu.net\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fposts&tags=106"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}